CAP’de bakteriyel etkenler; yaş, eşlik eden hastalıklar ve yerel direnç paternlerine göre değişir. Sık konuşulanlar arasında Streptococcus pneumoniae ve Haemophilus influenzae yer alır. Bazı koşullarda Staphylococcus aureus (özellikle viral enfeksiyon sonrası) önem kazanabilir. Klebsiella pneumoniae ve diğer Gram-negatif etkenler bazı risk profillerinde daha belirgin olabilir. Atipik grupta Mycoplasma pneumoniae klinik olarak CAP’ye benzer tablo oluşturabilir. Tedavi planı bu olasılıkların üzerine kurulur; mümkün olduğunda testlerle hedefe yönelik daraltma yapılır. Bu yaklaşım hem klinik başarıyı artırır hem de gereksiz geniş antibiyotik kullanımını azaltır.