CAP’de “en sık tespit edilen” etken, test yapılma sıklığına ve test türüne bağlı olarak değişebilir. Birçok CAP olgusunda etken mikroorganizma laboratuvarla kesinleştirilemez; çünkü her hastada kültür/PCR yapılmaz veya sonuç vermeyebilir. Bu nedenle klinik raporlarda en sık “tanımlanan” etkenler ile gerçek dünyadaki dağılım birebir örtüşmeyebilir. Yine de klasik olarak Streptococcus pneumoniae CAP için önemli bir patojen kabul edilir; viral sezonlarda influenza gibi virüslerin payı artabilir. Operasyonel olarak doğru yaklaşım; etkenin her zaman saptanamayacağını kabul ederek risk bazlı yönetim yapmak, klinik yanıtı izlemek ve gerektiğinde tedaviyi yeniden düzenlemektir.