Eski interferon temelli tedavilere kıyasla güncel DAA tedavileri genellikle daha kolay tolere edilir. Yine de bazı hastalarda yorgunluk, baş ağrısı, bulantı veya uyku düzeninde değişiklik gibi yan etkiler görülebilir. Bu etkiler çoğu zaman hafif-orta düzeydedir. En kritik risk alanı ise ilaç etkileşimleridir; bazı eşlik eden ilaçlar antiviral düzeylerini etkileyebilir veya yan etki yükünü artırabilir. Bu yüzden tedavi sürecinde tüm ilaçların (takviye dahil) hekim tarafından değerlendirilmesi önemlidir.