Çok fazla karpuz yemek bazı kişilerde şişkinlik, mide dolgunluğu, gaz, ishal veya kan şekeri dalgalanmasına neden olabilir. Karpuz düşük kalorili olsa da büyük porsiyonlarda tüketildiğinde toplam doğal şeker ve kalori alımı artar. Özellikle diyabet, insülin direnci veya kilo kontrolü hedefi olan kişiler porsiyona dikkat etmelidir. Sağlıklı bireyler için ölçülü karpuz tüketimi genellikle güvenlidir; ancak her besinde olduğu gibi karpuzda da denge temel prensiptir.