Fare pisliğiyle ilişkili en bilinen hastalıklardan biri hantavirüs enfeksiyonudur. Enfekte kemirgenlerin dışkısı, idrarı veya tükürüğü kuruduğunda, bu maddeler toz haline gelerek havaya karışabilir. İnsanlar bu kirli tozu soluduğunda enfeksiyon riski oluşur. Bunun dışında fareler leptospiroz, salmonella ve bazı paraziter hastalıkların taşınmasında da rol oynayabilir. Bu nedenle fare pisliği bulunan alanlar kuru süpürülmemeli veya elektrikli süpürgeyle temizlenmemelidir. Alan önce havalandırılmalı, ardından uygun dezenfektanla nemlendirilerek eldiven ve maske kullanılarak temizlenmelidir.