Florürün olası yan etkileri çoğunlukla aşırı maruziyetle ilişkilidir. Çocukluk döneminde fazla alım diş florozisine yol açabilir. Çok yüksek ve akut alımda mide şikâyetleri görülebilir. Topikal kullanımda (macun) en pratik risk; yanlışlıkla yutma ve aşırı miktar kullanımıdır. Doğru doz ve doğru kullanım bu riskleri belirgin şekilde azaltır.