Kolesterol haplarının yan etkileri kullanılan ilaca ve kişisel sağlık durumuna göre değişebilir. Atorvastatin gibi statinlerde en sık konuşulan yan etkiler kas ağrısı, halsizlik, baş ağrısı, mide-bağırsak şikâyetleri ve karaciğer enzimlerinde yükselmedir. Çoğu yan etki hafif düzeydedir; ancak nadiren ciddi kas hasarı gibi önemli durumlar gelişebilir. Bu nedenle ilacı kullanırken beklenmeyen belirtiler ortaya çıkarsa doktora danışılmalıdır. Kolesterol ilacı doktor önerisi olmadan bırakılmamalıdır çünkü tedavinin kesilmesi kalp-damar riskini yeniden artırabilir.