Bromelain çoğu kişide kısa süreli ve düşük-orta dozlarda tolere edilebilir; ancak yan etki profili kişiye, doza ve eşlik eden ilaçlara göre değişir. En sık bildirilenler mide-bağırsak şikâyetleridir: mide yanması, bulantı, karın ağrısı, ishal veya gaz. İkinci önemli başlık alerjik reaksiyonlardır: ananas alerjisi olanlarda, lateks/polen gibi çapraz reaksiyon riski olanlarda kaşıntı, döküntü, ağız-boğaz irritasyonu veya daha ciddi reaksiyonlar görülebilir. Üçüncü kritik başlık kanama eğilimidir. Bromelainin trombosit fonksiyonu/kanama mekanizmalarıyla ilişkili olabileceği, bu yüzden özellikle aspirin, klopidogrel, warfarin, DOAC grubu kan sulandırıcılar, bazı NSAİİ’ler ve bitkisel kanama riskini artırabilen ürünlerle birlikte dikkat gerektirdiği vurgulanır. Diş eti kanaması, kolay morarma, burun kanaması gibi bulgular varsa kullanım durdurulmalı ve değerlendirme yapılmalıdır. Ameliyat/diş çekimi planında, hekim genellikle takviyelerin belirli bir süre önce kesilmesini isteyebilir. Ayrıca kalp çarpıntısı gibi şikâyetler nadir olsa da, ürün içeriğinde kafein/uyarıcı varsa ayırt etmek gerekir. Güvenli kullanımın ana anahtarı: etiket, etkileşim taraması ve riskli gruplarda hekim onayıdır.