Endoskopi her reflü şikâyetinde zorunlu değildir. Tipik semptomları olan, alarm bulgusu taşımayan hastalarda hekimler çoğu zaman yaşam tarzı düzenlemesi ve kısa süreli tedavi denemesiyle klinik yanıtı izleyebilir. Ancak alarm bulguları (yutma güçlüğü, kanama bulguları, kilo kaybı, kansızlık, sürekli kusma), uzun süredir devam eden ve tedaviye dirençli şikâyetler veya komplikasyon şüphesi varsa endoskopi güçlü şekilde gündeme gelir. Endoskopi; özofajit, darlık, Barrett gibi hasarları görmeye ve farklı tanıları dışlamaya yarar. Endoskopi şart değilse bile, semptomların sıklığı ve gece etkisi yüksekse profesyonel bir planlama şarttır. Amaç, gereksiz işlem yapmak değil; doğru hastada doğru doğrulamayı sağlamaktır.